為了拓展國民的心靈視野，活化思辯體驗的空間，培養實踐崇高理想的能力，林義雄、方素敏夫婦於1991年3月，邀集至親好友成立「慈林基金會」。期盼以此匯聚眾多心力，為台灣民族的生機與遠景，提供一份渺小但意義長存的奉獻。

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慈林基金會相信：「人心的善惡決定了人間的歡樂或悲苦，社會的祥和或紛擾。救苦渡厄不是菩薩的責任，人間樂園也不是上天的恩賜。而是人類就自身心靈不斷地錘鍊和提升的事工。求真求善求美的文化和教育是從事這項事工的主要媒介。」

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基於以上的信念，基金會於1994年完成「慈林文教中心」的興建，推展各項型塑民族高貴心靈的文教事工。

為開拓國民的心靈與視野，充實國民生活內涵，基金會成立「慈林學苑」，提供進修場所，營造研修機會，期能建立終身學習的社會，使國民的智慧與智能不斷成長。

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「慈林學苑」已辦理或正在辦理的文教活動有慈林青年營、青年領導營、社會發展研修班、政治家研修班、認識台灣文化營、國際青年台灣文化營、兒童音樂夏令營、人間智慧研修班、書鄉之旅、蘭陽知性之旅、合唱團、讀書會、語言班、慈林之夜音樂會等。
同時也設置「台灣社會運動史料中心」，有系統地收集和保存台灣的社運團體與社會運動的資料，扮演台灣社運變遷的紀錄者、保存者及整理者的角色，成為台灣研究社會運動的專門圖書館。「台灣民主運動館」展示台灣民主運動史為主軸，並收藏百年來台灣民主運動之珍貴史料，記錄民主發展的歷史軌跡，規劃民主教育課程，出版相關著作，俾使一般國民及學生能藉由參訪體會、討論激盪，從中獲得啟發、鼓舞或警惕，進而堅定民主信仰並努力實踐。
 

以及為紀念在1980年2月28日，所發生的『林宅血案』受難者林游阿妹和和亮均、亭均小妹妹，將林家故居整建的「慈林紀念館」。這裡是林游女士二十歲時與林同先生結婚，三十一歲守寡、獨力撫養一子三女長大成人的地方。於整建時除秉持『原址、原貌』的保存原則外、並重塑信義路舊宅的入口記憶，使本館融合三個不同時代的建築空間背景，呈現三合一的歷史空間。館中陳列輓聯、哀悼詩文及部份遺物。

「慈林紀念館」因具歷史意義與其年代久遠的閩南式建築風格，2002年已由宜蘭縣政府列為歷史建築。

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